主要致力于海洋数值模拟与数据同化研究，在国内外杂志上发表文章60余篇，承担了国家基金项目、国家973课题、公益性行业专项课题和重点研发计划等多项研究任务。近年来，在多变量联合同化调整和高效并行计算等研究方面取得重要成果，发展了海洋全要素高效并行数据同化系统，有效提高了海洋预报能力和气候预测水平，发布了我国首套全球高分辨率再分析数据。基于kalman滤波原理，通过变量间的协方差表征海洋动力学特征以及多种影响因素之间的相互作用，有效利用观测信息优化其周围网的各种变量，实现多变量联合同化调整。作为核心成员，突破了负载近绝对均衡、主从核协同计算框架设计和循环折叠流水线等若干关键技术，为海洋数值预报系统建设提供了技术支撑。据此研发了海洋全要素高效并行数据同化系统，已成功应用到21世纪海上丝绸之路海洋环境预报、第二代海洋环境保障等多个预报系统，并支撑了气候预测和观测设计优化等研究的开展。
1. xunqiang yin, junqiang shi and fangli qiao，2018, evaluation on surface current observing network of high frequency ground wave radars in the gulf of thailand, ocean dynamics, 68:575–587，doi: 10.1007/s10236-018-1149-5.
2. xunqiang yin, fangli qiao, yongzeng yang, changshui xia and xianyao chen, 2012, argo data assimilation in ocean general circulation model of northwest pacific ocean. ocean dynamics. 62(7): 1059-1071, doi: 10.1007/s10236-012-0549-1.
3. xunqiang yin, fangli qiao, changshui xia, xingang lü and yongzeng yang, 2010, reconstruction of eddies by assimilating satellite altimeter data into princeton ocean model, acta oceanologica sinica, 29(1): 1-11 , doi: 10.1007/s13131-010-0001-7.
4. yin xunqiang, qiao fangli, yang yongzeng and xia changshui. 2010, an ensemble adjustment kalman filter study for argo data, chinese journal of oceanology and limnology, 28(3): 625-635, doi: 10.1007/s00343-010-9017-2.
5. yin xunqiang, qiao fangli and shu qi.2011, using ensemble adjustment kalman filter to assimilate argo profiles in a global ogcm. ocean dynamics, 61(7): 1017-1031, doi: 10.1007/s10236-011-0419-2.
6. xunqiang yin, lie-yauw oey, 2007, bred-ensemble ocean forecast during katrina: loop current and ring. ocean modelling, 17(4): 300-326, doi: 10.1016/j.ocemod.2007.02.005.
7. meng sun, xunqiang yin, yongzeng yang, kejian wu, 2017, an effective method based on dynamic sampling for data assimilation in a global wave model, ocean dynamic,, 67:433–449，doi: 10.1007/s10236-017-1030-y.
8. chengcheng yu, yongzeng yang, xunqiang yin, meng sun and yongfang shi, 2020, impact of enhanced wave-induced mixing on the ocean upper mixed layer during typhoon nepartak in a regional model of the northwest pacific ocean, remote sensing, 12, 2808, doi:10.3390/rs12172808.
9. yiding zhao, xunqiang yin, yajuan song and fangli qiao, 2019, seasonal prediction skills of fio-esm for north pacific sea surface temperature and precipitation. acta oceanologica sinica, 38(1):5-12，doi: 10.1007/s13131-019-1366-x.
10. hui chen, xunqiang yin, ying bao and fangli qiao, 2016, ocean satellite data assimilation experiments in fio-esm using ensemble adjustment kalman filter. science china: earth sciences, 59(3):484-494，doi: 10.1007/s11430-015-5187-2.
获奖与荣誉
1. 2020.06，第二代全球浪潮流耦合海洋环境预报系统及应用，海洋工程科学技术奖，特等奖，中国海洋工程咨询协会，排名4/13
2．2016.02，海洋模式高效并行集合调整卡尔曼滤波同化系统的研发与应用，海洋工程科学技术奖，二等奖，国家海洋局、中国海洋工程咨询协会，排名2/9
3. 2015.03，包含海浪的新型全球气候数值模式的建设与应用，海洋工程科学技术奖，一等奖，国家海洋局、中国海洋工程咨询协会，排名9/12
4. 2016.06，a highly effective global surface wave numerical simulation with ultra-high resolution，戈登贝尔奖入围奖，排名3/12
主持项目
1.02018.12-2021.12 国家重点研发计划项目专题，全球耦合模式的海洋资料同化系统与重要物理过程改进研究， 65.5万元，主持。
2. 2012.01-2014.12 国家自然科学基金，中尺度涡旋在海洋混合中的作用研究（41106032）， 25/25万元，主持。
3. 2014.01-2018.12 国家重点基础研究计划973计划项目课题，岛屿周边海洋动力过程超高分辨率数值模式（2014cb745004），396万元，主持。
4. 2015.01-2018.12 科技部海洋公益性行业科研专项子任务a201524课题，数据搜集整理与敏感区补充观测（201505013-1），227万元，主持。
5. 2018.01-2020.12 国家海洋局预报减灾业务运行经费，多源海洋卫星资料同化系统研制与业务应用，125万元，主持。
6. 2016.01-2016.12 浙江省海洋预警报能力升级改造项目，浪潮流一体化耦合模式开发，90万元，主持。
7. 2008.01- 2010.12 海洋一所基本科研业务专项资金项目，基于mpi的多源海洋观测资料集合调整kalman滤波并行同化研究， 20万元，主持。
8. 2012.01-2012.12 海洋一所基本科研业务专项资金项目，中尺度涡旋在海洋混合中的作用研究，20万元，主持。
9. 2020.01-2020.12 科学技术部援外培训项目，南亚与东南亚国家海洋与气候变化国际培训班（2047），21.096万元，主持。
10. 2021.01-2021.12 中国—东盟国家蓝色伙伴关系建设项目，odc中心建设运行，100万元，主持